Dr. Öğr. Üyesi
MERVE
PEKİNCE ÖZÖNER

Başlama Tarihi : 06.05.2024
Bitiş Tarihi :
Proje Konusu : Hayvan ıslahı çalışmalarının birincil ve en önemli basamağı değerli erkek damızlık hayvanların seçilmesi ve/veya üretilmesidir. Bu bağlamda, damızlık adaylarına ait sperma kalitelerinin ortaya konulması ve potansiyel fertilite yetenekleri hakkında fikir sahibi olunması önem arz eder. Bu amaçla, konvansiyonel analizlerin yanında sperma kalitesi ve fertilite yeteneği ile ilişkili biyo-markerlerin keşfi ve doğrulanması adına bilimsel çalışmaların yürütülmesinin oldukça önemlidir.ProAKAP4 spermatozoon fibröz kılıfı yapısında yer alan, sperma kalitesi ve fertilite yeteneğinin objektif olarak belirlenmesinde biyo-marker olarak değerlendirilen bir proteindir. proAKAP4' ün teke sperması spermatolojik parametreleri üzerine etkisini gösteren çalışma sayısı oldukça kısıtlıdır.Sunulan projede Boer ve Anglo-Nubian ırkı tekelerde taze sperma proAKAP4 seviyesinin belirlenmesi ve ırklar arası varyasyonun olup olmadığı, eritme sonrası CASA parametreleri (0., 1., 2. ve 4. saatlerde), kapasitasyon durumu, oksidatif stres ve antioksidan sistem değerleri, proAKAP4 ve AKAP4 proteinleri floresan yoğunlukları ile ilişkinin belirlenmesi amaçlanmaktadır. Sonuç olarak, proAKAP4 protein seviyesinin teke sperması kalitesi ve potansiyel fertilite yeteneğinin belirlenmesinde biyo-marker olarak kullanımının değerlendirilmesi amaçlanmaktadır.
Proje Konum : Araştırmacı
Proje Türü : Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi
Güncelleme Tarihi : 2024-06-02 21:13:52

Başlama Tarihi : 30.04.2024
Bitiş Tarihi :
Proje Konusu : Gebelik, yeterli fetal gelişim ve büyümenin sağlanması için enerji ve oksijen tüketiminde artışla karakterize fizyolojik bir süreçtir. Gebelikle beraber artan negatif enerji dengesi oksidatif strese nedeni olabilir; artan lipit peroksidasyonu ve azalan antioksidan aktivite, gebelikte komplikasyonların gelişmesine katkıda bulunmaktadır. Bu nedenle hem annenin hem de fetüsün hamilelik sırasında oksidatif stres yaşaması muhtemeldir. Sunulan çalışmada gebe olmayan ve gebeliğinin ilk döneminde olduğu tespit edilen keçi uterus dokusunda antioksidan/oksidan markerlerın ( süperoksit dismutaz, 4-hidroksinonenal, nüklear faktör kappa B) ve steroid hormonların (androjen reseptör, östrojen reseptör ve progesteron reseptör) spesifik hücre lokalizasyonlarına belirlenmesi amaçlanmaktadır. Ayrıca spesifik hücre lokalizasyonları belirlenen bu yapılarda proteinlerin ekspresyon farklılıkları Western blot yöntemi ile ortaya konulacaktır. Böylece gebeliğin ilk döneminde olduğu tespit edilen hayvanlar ile gebe olmayan hayvanlardan elde edilen uterus dokusunda, organizmada sürekli denge halinde salgılanan steroid hormonlar ve gebeliğin ilk döneminde meydana gelen olası oksidatif stres arasındaki bağlantının ortaya konulması amaçlanmaktadır. Sunulan çalışmada 20'si gebe olmayan, 20'si gebeliğinin ilk döneminde olduğu tespit edilen 40 adet keçiden uterus ve fetüs örnekleri bölgedeki kesimhanelerden toplanacaktır. Elde edilen bu örneklerden fötüs baş-sağrı uzunluğu dikkate alınarak gebeliğinin ilk döneminde olan hayvanlar tespit edilecektir. Gruplandırılmış uterus dokularında immunohistokimyasal ve western blot yöntemler kullanılarak süperoksit dismutaz, 4-hidroksinonenal, nüklear faktör kappa B, androjen reseptör, östrojen reseptör ve progesteron reseptör parametreleri incelenecektir. Elde edilen verilerin istatistiksel olarak değerlendirmesi yapılacaktır.
Proje Konum : Yürütücü
Proje Türü : Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi
Güncelleme Tarihi : 2024-06-02 21:12:41

Başlama Tarihi : 29.03.2024
Bitiş Tarihi :
Proje Konusu : Koyun ve keçilerde solunum yolu hastalıkları streslere maruz kalındığında, çeşitli enfeksiyöz ajanlar nedeniyle solunum yollarındaki hasar sonucu ortaya çıkmaktadır. Akciğer yangıları bronkopnömoni, intersitisyel pnömoni, embolik pnömoni ve granülomatöz pnömoni olarak sınıflandırılmaktadır. Son zamanlarda gelişen teknolojilerle birlikte dijital patoloji yaygın olarak kullanılmaya başlamıştır. Ancak dijital patolojiye girişte cihaz maliyetleri yüksek olduğundan alternatif olarak açık kaynaklı mikroskop sistemleri alternatif olarak kullanılmaya adaydır. Ayrıca dijital patoloji sistemleriyle elde edilen histopatolojik görüntüler işlenerek, derin öğrenme algoritmalarıyla hastalık tanısı ve prognozuyla ilgili objektif sonuçlar elde edilmiştir Sunulan projenin amacı açık kaynaklı dijital mikroskoplarla elde edilen histopatolojik görüntülerin işlenerek derin öğrenme yöntemiyle koyun ve keçilerde görülen akciğer yangılarının sınıflandırılması amaçlanmaktadır.Sunulan projede Siirt ilinde kesime gönderilen koyun ve keçilerde makroskobik olarak konsolidasyon, fibrin plakları ve kollabe olmayan akciğer örnekleri toplanacaktır. Toplanan örnekler doku takip aşamalarından sonra 4-5 mikrometre kalınlığında kesitler alınarak, Hematoksilen-Eozin boyama yöntemiyle boyanacaktır. Boyanan kesitlerde patolog tarafından yangının tipi belirlendikten sonra, açık kaynaklı mikroskop sisteminde preparat taraması yapılarak dijital ortama aktarılacaktır. Sınıflandırma için yeterli örnek elde edildikten sonra derin öğrenme yöntemiyle yangının sınıflandırılması düşünülmektedir. Dijital patoloji sistemleri ve derin öğrenme veteriner hekimlikte yaygın olarak kullanılmamaktadır. Ancak, bu sistem sayesinde preparatlar herhangi bir bozulma olmadan uzun süre saklanması ve tanıda yardımcı olarak objektif sonuç alınmasına destek vermesi planlanmaktadır.
Proje Konum : Araştırmacı
Proje Türü : Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi
Güncelleme Tarihi : 2024-06-02 21:13:43

Başlama Tarihi : 31.10.2023
Bitiş Tarihi :
Proje Konusu : Gentamisin (GM), Gram-negatif bakterilerin neden olduğu enfeksiyonların tedavisinde etkinliği yüksek, spektrumu geniş, antibakteriyel etki gücü yüksek antibiyotiklerindendir. Nefrotoksik ve ototoksik yan etkilerinden dolayı uzun süreli kullanımı sınırlandırılmaktadır. Gentamisin kaynaklı nefrotoksisitesinin patolojinin araştırılmasında birçok yol ortaya konulmuş olup bunlardan biri artan serbest radikallerin dengesinin bozulmasından kaynaklı oksidatif stresdir. Ortaya çıkan oksidatif stres ile indüklenen nefrotoksik etkiye karşı çalışmamızda antioksidan içeriği yönünden zengin içeriğe sahip yalancı iğdenin iyileştirici etkisine bakılması amaçlanmaktadır.Çalışmamızda 32 adet erkek Wistar soyu ya da Spraque Dawley ratlar her grupta 8 erişkin erkek sıçan olacak şekilde kontrol grup, Gentamisin, yalancı iğde grubu ve Gentamisin+ Yalancı iğde olmak üzere 4 gruba ayrılacaktır. Deney başlangıcında tüm grupların canlı ağırlıkları ölçülecektir. Kontrol grubu hayvanlara fizyolojik tuzlu su 8 gün süreyle (i.p) verildi. Gentamisin grubuna 100 mg/kg gentamisin periton içi 8 gün, Yalancı iğde grubuna 1 ml/kg/gün yalancı iğde yağı oral gavaj yol ile 8 gün, Gentamisin + Yalancı iğde grubuna 100 mg/kg gentamisine i.p. uygulaması yanında 1 ml/kg/gün yalancı iğde yağı oral gavaj yol uygulanacaktır.Deney sonunda her bir deneğin canlı ağırlıkları ölçülerek ketamin-ksilazin anestezisi (80- 100 mg/kg ketamin ve 5-10 mg/kg ksilazin) uygulanacaktır. Deneklerin her birinin sağ/sol böbrek ağırlıkları ölçüldükten sonra histopatolojik ve immunohistokimyasal boyamalar ile (indüklenebilir nitrik oksit sentataz (iNOS) ve kaspaz-3) incelemek için böbrek dokular formaldehit solüsyonuna alınacaktır. Elde edilen veriler istatistiksel olarak değerlendirilecektir.
Proje Konum : Yürütücü
Proje Türü : Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi
Güncelleme Tarihi : 2024-06-02 21:13:33

Başlama Tarihi : 17.11.2022
Bitiş Tarihi :
Proje Konusu : Sinus interdigitalis memeli hayvanlardan özellikle koyunların parmakları arasına yerleşmiş bir deri invaginasyonu olarak bilinmektedir. Şekil itibariyle çeşitli hayvanlarda soket, pipo veya boruya benzediği bildirilmiştir. İnterdigital sinusten salgılanan koku maddesi feromonlar, ketonlar, aldehitler ve alkanlar gibi buharlaşan elementlerden oluşur. Salgılanan içeriğin cinsel iletişimden sorumlu olduğu raporlanmıştır. Bezden gelen kimyasal salgıların geviş getirenlerin sosyal ve biyolojik davranışlarında önemli bir rol oynadığı ve bölgesel tayin için de faydalı olduğu bildirilmektedir.İnterdigital bez bulunduğu bölgede derinin elastikiyetine katkıda bulunur, ultraviyole ışınlarından korunmada rol oynar, mantar öldürücü ve bakterisit etkileri vardır. Ayrıca konumu ve yapısı klinik önemine katkıda bulunur. Bez konumu nedeniyle, özellikle ilkbaharda kötü hijyen koşulları ve yüksek nem sonucu oluşabilen interdigital sinüzit gibi enfeksiyonlara ve beze giren yabancı cisim kaynaklı mekanik yaralanmalara maruz kalmaktadır. Topallık ile interdigital sinus arasındaki ilişki henüz tanımlanmamakla birlikte, topallık vakalarının yaklaşık %16'sına sinus'ün yangısı eşlik etmektedir.Çalışmamızda, erkek ve dişi Siirt Hamdani Melezi Koyunlar (Ovis aries) kullanılacaktır. Üreme mevsimi sırasında ve dışında koyunlara ait ön ve arka ayaklar sabit bir kasaptan elde edilecektir.Toplanan ayaklarda interdigital sinus diseke edilerek çıkarılacak, anatomik lokasyonu belirlenecektir. Bezin morfometrik ölçümleri yapılacak, tespit için formaldehit solüsyonuna alınacaktır. Tespit işlemi sonrası rutin prosedürler ile parafin mumuna gömülecektir. Bu şekilde oluşturulan bloklardan 5-7 μm kesitler alınarak Masson trikrome boyama ve Hematoxylen -- Eozin boyama yöntemleri ile kesitler boyanacaktır.Çalışma Siirt Hamdani melezi koyunların interdigital bezlerinin morfolojik ve histolojik yapılarını inceleyen ilk çalışmadır. Elde edilen veriler ile bezin üreme davranışı ile ilişkisi hem ana...
Proje Konum : Araştırmacı
Proje Türü : Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi
Güncelleme Tarihi : 2024-06-02 21:12:52

Başlama Tarihi : 14.06.2021
Bitiş Tarihi : 13.06.2022
Proje Konusu : Diyabet, pankreastan salgılanan insülin hormonunun yetersizliği ve insülin hormonunun yeterince kullanılamaması sonucu meydana gelen sadece karbonhidrat değil, aynı zamanda protein ve yağ metabolizmasını etkileyen endokrin bir hastalıktır. Oksidatif stresin diyabet etiyolojisinde rol oynadığı görülmektedir. Normal sağlıklı kişilerde serbest radikaller/antioksidanlar denge halindedir. Diyabette ise bu denge serbest radikaller lehine bozulmuştur.Hippophae rhamnoides L. antioksidan bir madde olarak bilinmektedir. Bu bitkinin diyabet ile yapılan birçok çalışmada kullanıldığı bildirilmiştir. Streptozotosin ile indüklenen deneysel diyabet çalışmalarında, yalancı iğdenin, koruyucu etkisi gözlemlenmiştir. Buna ilaveten, yine son yıllarda keşfedilen İrisin, Asprosin ve Subfatin gibi, glikoz metabolizmasında etkili olan ve enerji metabolizması ile de ilişkileri bulunan hormonların, diyabet hastalığının aydınlatılmasında da rol model olacağı düşünülmektedir. Sunulan çalışmamızda deneysel olarak STZ ajanı ile diyabet oluşturulan erkek ratların, diyabet sonrası böbrek ve testis dokularının histopatolojik olarak incelenmesi ayrıca İrisin, Asprosin ve Subfatin'in olası hücresel dağılımının immünohistokimyasal olarak inceleyerek, antioksidan yönünden zengin olan SBT'nin diyabetteki hasarlı dokular ve İrisin, Asprosin ve Subfatin üzerine olası koruyucu etkisinin araştırılması amaçlanmaktadır.Bu çalışmada 8-10 haftalık 39 adet Wistar ırkı erkek sıçan 5 gruba ayrılacaktır. STZ ile deneysel diyabet oluşturulan erkek sıçanlara koruyucu antioksidan madde olarak SBT ekstratı gavaj yoluyla verilecektir. Bu gruplara karşılık kontrol grupları oluşturulacaktır. Ratların kan-glikoz değerleri ve canlı ağırlıkları 8 saatlik açlık sonrası 0, 3, 7. ve 60. günlerde ölçülecektir. Sekiz hafta sonra sıçanlar sakrifiye edilecektir ve testis ve böbrek dokuları alınacaktır. Alınan dokular histopatolojik ve immünohistokimyasal olarak incelenecektir. Elde edilen veriler ortalama ± standart sa...
Proje Konum : Araştırmacı
Proje Türü : Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi
Güncelleme Tarihi : 2022-06-28 10:36:47